一、基本信息

姓名：邢永强

职称： 教授

教育经历

2010年9月—2014年6月，内蒙古大学生物物理学专业（博士研究生）

2006年9月—2009年6月，内蒙古大学生物物理学专业（硕士研究生）

2002年9月—2006年6月，内蒙古师范大学物理学专业（本科）

学术身份：内蒙自然科学基金杰出青年基金获得者、内蒙古生物物理与生物信息学会常务理事兼副秘书长、中国生物信息学学会多组学与整合生物学专委会委员、中国生物信息学学会表观遗传学专委会委员、中国计算机学会生物信息学专委会委员、中国医药教育协会数字医疗专业委员会委员、内蒙古健康数字学会理事、中国计算机学会高级会员。

所属系部和专业方向：生物信息学/生物信息学

二、研究领域

研究方向：利用多组学数据整合分析和人工智能方法理解RNA剪接、胚胎发育、疾病发生等调控机制。

学术成果与荣誉：内蒙古自治区英才兴蒙五类人才、内蒙古自治区新时代专业技术人才、内蒙古自治区“草原英才”工程青年创新人才、内蒙古自治区高校“青年科技英才”、包头市鹿城英才、内蒙古科技大学151人才（首届）。

代表性论文与著作

[1] Wei Wang, Yu Zhang, Yuanyuan Zhai, Wuritu Yang, Yongqiang Xing*. Alternative splicing dynamics during gastrulation in mouse embryo. Scientific Reports, 2025,15:10948.

[2] Hongxia Chi, Yu Zhang, Anqi Li, Pengwei Hu, Wuritu Yang, Yongqiang Xing*. Analysis of alternative splicing heterogeneity in early mouse embryonic development. Current Bioinformatics, 2025, DOI: 10.2174/0115748936376211250429102627.

[3] Yu Zhang†, Zhiyan Jiang†, Yuanyuan Zhai*, Yongqiang Xing*. Investigating the Mechanism of Astragalus mongholicus-Mediated Treatment of Silicosis in Mouse from the Perspective of Alternative Splicing. Current Drug Targets, 2025, Accept.

[4] Lei Zheng, Pengfei Liang, Chunshen Long, Hanshuang Li, Haicheng Li, Yuchao Liang, Xiang He, Qilemuge Xi, Yongqiang Xing*, Yongchun Zuo*. EmAtlas: a comprehensive atlas for exploring spatiotemporal activation in mammalian embryogenesis. Nucleic Acids Research, 2023, 51(D1):D924-D932.

[5] Hao Wang†, Zhaoyue Zhang†, Haicheng Li†, JinZhao Li, HanShuang Li, MingZhu Liu, Pengfei Liang, Qilemuge Xi, Yongqiang Xing*, Lei Yang*, Yongchun Zuo*. A cost-effective machine learning-based method for preeclampsia risk assessment and driver genes discovery. Cell & Bioscience, 2023, 13:41.

[6] Jinzhao Li, Xiang He, Shuang Gao, Yuchao Liang, Zhi Qi, Qilemuge Xi, Yongchun Zuo*, Yongqiang Xing*. The Metal-binding Protein Atlas (MbPA): an integrated database for curating metalloproteins in all aspects. Journal of Molecular Biology, 2023, 435(14):168117.

[7] Lei Zheng, Dongyang Liu, Yuan Alex Li, Siqi Yang, Yuchao Liang, Yongqiang Xing *, Zuo Yongchun*. RaacFold: a webserver for 3D visualization and analysis of protein structure by using reduced amino acid alphabets. Nucleic Acids Research, 2022, 50(W1): W633-W638.

[8] Zhe Liu, Wei Wang, Xinru Li, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao, Wuritu Yang, Yongchun Zuo, Lu Cai, Yongqiang Xing*. Temporal dynamic analysis of alternative splicing during embryonic development in Zebrafish. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2022, 10:879795.

[9] Yongqiang Xing, Wuritu Yang, Guoqing Liu, Xiangjun Cui, Hu Meng, Hongyu Zhao, Xiujuan Zhao, Jun Li, Zhe Liu, Michael Q. Zhang*, Cai L*. Dynamic alternative splicing during mouse preimplantation embryo development. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2020, 8:35.

[10] Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Tao Yu, Dong liang, Jun Li, Guanyun Wei, Guoqing Liu, Xiangjun Cui, Hongyu Zhao and Lu Cai*. MiasDB: A database of molecular interactions associated with alternative splicing in human pre-mRNAs. PloS ONE, 2016, 11(5): e0155443.

[11] Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao, Lu Cai*. Genome-wide characterization and prediction of Arabidopsis thaliana replication origins. Biosystems, 2014, 124:1-6.

[12] Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. An analysis and prediction of nucleosome positioning based on information content. Chromosome Research, 2013, 21(1):63-74.

[13] Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. Prediction of Nucleosome Occupancy in Saccharomyces cerevisiae Using Position-Correlation Scoring Function. Genomics, 2011, 98(5): 359-366.

[14] 张宇, 池红霞, 杨乌日吐, 左永春*, 邢永强*. 哺乳动物可变多聚腺苷酸化. 生物化学与生物物理进展, 2025, 52(01):32-49.

[15] 邢永强*, 王延新, 何泽学, 崔向军, 刘国庆, 孟虎, 赵宏宇, 赵秀娟, 蔡禄*. 拟南芥种子萌发过程中差异表达基因的识别和pre-mRNA可变剪接图谱的构建. 科学通报, 2019, 64(36):3844-3855.

[16] 邢永强* , 何泽学, 刘国庆, 蔡禄*. 拟南芥不同组织基因表达及可变剪接差异分析. 生物化学与生物物理进展, 2019, 46(11): 1118-1129.

[17] Jixiang Xing, Siqi Yang, Yuchao Liang, Pengwei Hu, Bingjie Dai, Hanshuang Li, Yongqiang Xing, Yongchun Zuo*. Deciphering sequence determinants of zygotic genome activation genes: insights from machine learning and the ZGAExplorer platform. Cell Proliferation, 2025, 18:e70039.

[18] Guojun Liu, Yan Shi, Hongxu Huang, Ningkun Xiao, Chuncheng Liu, Hongyu Zhao, Yongqiang Xing, Lu Cai*. FPCAM: A Weighted Dictionary-Driven Model for Single-Cell Annotation in Pulmonary Fibrosis. Biology, 2025, 14(5), 479.

[19] Hongyu Zhao, Mingxin Guo, Fenghui Zhang, Xueqin Shao, Guoqing Liu, Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Liaofu Luo, Lu Cai*. Nucleosome assembly and disassembly in vitro are governed by chemical kinetic principles.  Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9:762571.

[20] Guoqing Liu*, Hongyu Zhao, Hu Meng, Yongqiang Xing, Lu Cai. A deformation energy model reveals sequence-dependent property of nucleosome positioning. Chromosoma, 2021, 130(1):27-40.

[21] Jun Li, Hongyu Zhao,Yongqiang Xing,Tongling Zhao, Lu Cai*, Zuwei Yan*. A genome-wide analysis of the gene expression and alternative splicing events in a whole-body hypoxic preconditioning mouse model. Neurochemical Research, 2021, 46:1101-1111.

[22] Hongyu Zhao, Zhiyan Jiang, Runchao Lv, Xue Li, Yongqiang Xing, Yanrong Gao, Da Lv, Yangming Si, Jingyan Wang, Jun Li, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. Tranncriptome profile analysis reveals a slica-induced immune response and fibrosis in a silicosisrat model. Toxicology Letters, 2020, 333:42-48.

[23] Guoqing Liu*, Hongyu Zhao, Hu Meng, Yongqiang Xing, Hui Yang, Hao Lin*. Deform-nu: a DNA deformation energy-based predictor for nucleosome positioning. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2020, 8:596341.

[24] Hongyu Zhao, Fenghui Zhang, Mingxin Guo, Yongqiang Xing, GuoQing Liu, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. The affinity of DNA sequences containing R5Y5 motif and TA repeats with 10.5-bp periodicity to histone octamer in vitro. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 2019, 37(8):1935-1943.

[25] Guoqing Liu*, Yongqiang Xing, Hongyu Zhao, Lu Cai, Jianying Wang. The implication of DNA bending energy for nucleosome positioning and sliding. Scientific Reports, 2018, 8:8853:1-12.

[26] Guoqing Liu*, Yongqiang Xing, Hongyu Zhao, Jianying Wang, Yu Shang, Lu Cai*. A deformation energy-based model for predicting nucleosome dyads and occupancy. Scientific Reports, 2016, 6:24133:1-14.

[27] Xiangjun Cui*, Lu Cai, Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Chenxia Shi. Influence factors on the correlations between expression levels of neighboring pattern genes. Biosystems, 2016, 139: 23-28.

[28] Guoqing Liu*, YongqiangXing, Lu Cai*. Using weighted features to predict recombination hotspots in Saccharomy cescerevisiae. Journal of Theoretical Biology, 2015, 382:15-22.

[29] Hongyu Zhao, Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Ping Chen, Xiujuan Zhao, Guohong Li*, Lu Cai*. GAA triplet-repeats cause nucleosome depletion in the human genome. Genomics, 2015, 106(2): 88-95.

[30] 专著: 蔡禄，赵秀娟，刘国庆，崔向军，马利兵，赵宏宇，邢永强. 《表观遗传学前沿》, 标准书号: 978-7-302-30817-1, 清华大学出版社, 49.3万字, 2012年. 撰写《染色质重塑》一章，共计5.2万字.

[31] 教材：蔡禄，邢永强，崔向军，刘国庆，崔大超.《生物信息学》标准书号: 978-7-030-55335-5科学出版社, 62.9万字, 2017年. 参编10万字.

[32] 教材：毛爱华，武娥，邢永强（副主编），李永治，刘艳丽，李丽荣，李颖.《大学物理实验》标准书号: 978-7-1114-8942-9, 机械工业出版社, 47.1万字, 2015年. 参编6.8万字.

[33] 教材：杨友松，赵存虎，邢永强（副主编），刘艳丽，李丽荣，李国峰.《大学物理实验基础》标准书号: 978-7-5635-3320-6, 北京邮电大学出版社, 36.2万字, 2013年. 参编5.0万字.

[34] 发明专利：一种环境内分泌干扰物多组学数据整合分析系统及方法，授权公告日：2025年08月29日，专利号：ZL202510848718.4，授权公告号：CN120356536B，发明人：卢元平，邢永强，黄星星，凌指航，蒋佩君，薛思博

科研项目

[1] 国家自然科学基金（面上），项目号：62371265, 完成时间：2024.01-2027.12

[2] 国家自然科学基金（地区），项目号：62161039，完成时间：2022.01-2025.12

[3] 国家自然科学基金（地区），项目号：61662055，完成时间：2017.01-2020.12

[4] 国家自然科学基金（应急管理），项目号：11547150，完成时间：2016.01-2016.12

[5] 内蒙自然科学基金杰出青年基金，项目号：2024JQ10，完成时间：2024.01-2026.12

[6] 内蒙古自治区科技计划项目，项目号：2025KYPT0135，完成时间：2025.03-2028.03

[7] 2020年度自治区“青年科技英才”支持计划，项目号：NJYT-20-B05，完成时间：2020.01-2021.12

[8] 内蒙自然科学基金，项目号：2018MS03024，完成时间：2018.01-2020.12

[9] 内蒙自然科学基金，项目号：2014MS0312，完成时间：2014.01-2016.12

[10] 内蒙古自治区直属高校基本科研业务费项目（支持科技领军人才和创新团队建），项目号：2023RCTD023，完成时间：2023.01-2025.12

[11] 内蒙古科技大学优秀青年科学基金，项目号：2019YQL01，完成时间：2019.12-2021.12

[12] 内蒙古科技大学创新基金，项目号：2014QDL012，完成时间：2014.12-2016.12

实验室介绍

实验室依托内蒙古自治区生命健康与生物信息学重点实验室，开展利用多组学数据整合分析和人工智能方法理解RNA剪接、胚胎发育、疾病发生等调控机制的研究，现有多名青年博士和研究生组成。与内蒙古大学、包钢医院、包头市肿瘤医院等单位持续开展科研合作研究。