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生物信息学专业人才培养方案(2022版)

发布日期:2023-03-16   阅读:[]

生物信息学专业培养方案

一、专业简介

专业名称:生物信息学

专业代码:071003

专业特色:本专业适应国家与地区生物医学及大健康产业发展需求,课程设置兼顾数理、生物学知识的掌握和信息学、计算机技能的提高,以分析生物医学领域的大数据为主线,加强对生物学基础知识和数字信息处理技术的掌握,强化学生解决生物医学大数据分析问题的能力,通过本科生参与教师科研课题和组建学生科创团队等多种科研反哺教学的方式提升学生的创新创业能力,培养具有较强创新精神和实践动手能力的高素质应用型人才。

二、学制与学位

学制:4

授予学位:工学学士

三、培养目标与毕业要求

培养目标:

立足内蒙古,面向全国,培养具有良好的人文素养与职业素养,德智体美劳全面发展的社会主义事业建设者和接班人,掌握扎实的生物学基础知识和常规的生物信息学理论与算法,具备较强的编程与大数据数据分析能力,具有较强创新精神和实践动手能力,适应国家与地区生物医学及大健康产业发展需求的高素质应用型人才。毕业生主要面向生物技术、医疗卫生、大健康及大数据分析等相关企业和科研院所,从事大数据分析、软件研发及大数据智慧管理等工作。

本专业学生在毕业5年左右,经过自身学习和行业实践的锻炼,能达到以下具体培养目标:

培养目标1:具备良好的人文社会科学素养、健全人格、健康身体、正确价值观、较强的社会责任感和职业道德。

培养目标2:能够不断提升综合应用数学、物理、生物学等基础知识和信息处理等应用知识解决生物医学大数据分析过程的复杂数据分析问题的能力。

培养目标3能够跟踪生物医学大数据领域的数据管理与分析、算法研究与设计、软件开发与应用的前沿技术,设计解决实际问题的综合方案和模型,具有较强的实践能力与创新创业能力,且能成为行业专业技术骨干人员。

培养目标4:能够与时俱进,并通过不断学习来拓展自己的知识和能力,熟悉所从事行业或工程技术领域相关的经济、环境、健康、伦理、法律、网络安全、数据安全、生物安全等方面的影响因素。

培养目标5:具有跨文化交流与合作能力,能够在不同职能团队中发挥特定的作用并具备承担领导角色的能力。

毕业要求:

根据专业培养目标,基于知识、能力、素质的综合要求,结合本专业课程设置、教学大纲等情况,本专业设定的毕业要求总结如下:

1. 职业规范:具有人文底蕴、科学精神、职业素养和社会责任感,了解国情、社情、民情,践行社会主义核心价值观,能够在生物信息学实践中理解并遵守职业道德和规范,履行责任。

要求:具有人文社会科学素养、理解并遵守职业道德规范、履行社会责任。

1.1 有正确价值观,理解个人与社会的关系,了解中国国情;

1.2 理解诚实、诚信、公正的职业道德和规范,并能在实践中自觉遵守;

1.3 理解从事生物信息领域的工作人员对网络安全、数据安全、生物安全、公共安全、健康和福祉,以及环境保护等的社会责任,能够在实践中自觉履行责任。

2. 知识掌握:具有扎实的数理、生物学、计算机科学基础知识和生物信息学专业知识,掌握生物信息学专业必备的生物医学大数据分析和研究方法,了解本专业及相关领域最新动态和发展趋势。

要求:生物信息学专业相关的基础知识掌握扎实、研究方法和技术应用熟练、前沿知识应知应会、能够用已学知识准确描述生物医学和大健康领域的数据分析科学问题。

2.1 能够掌握数理化、生物学、计算机科学基础知识;

2.2 能够掌握生物信息学专业知识,理解常见的生物医学大数据分析方法的设计思路,并可以熟练地使用这些方法;

2.3 能够准确描述生物医学领域数据分析的复杂科学问题。

3. 问题分析:能够运用数理等自然科学的基本原理和生物信息学方法与技术,结合文献调研,发现、辨析、质疑、评价生物信息学专业及相关领域现象和问题,表达个人见解,且具有批判性思维和创新能力。

要求:应学会基于科学原理思考和发现问题,并利用已有知识进行质疑和评价,逐步形成分析科学问题的思维方法。

3.1 能运用数理等自然科学原理和生命科学知识,结合教材和文献资源发现生物信息学相关的科学问题;

3.2 能够从生物信息学视角理解科学问题并进行合理的分析和判别;

3.3 具有勇于批判、大胆质疑科学问题的精神,能够对生物信息学科学问题进行理性评价,获得有效结论。

4. 应用/设计:能够应用生物信息学相关的软件开发、数据库搭建等信息处理技术,设计管理和分析生物医学大数据的简单工具。

要求:熟练掌握计算机程序语言、数据结构和算法、数据库原理等计算机技能,可以设计管理和分析生物医学大数据的简单工具。

4.1 掌握用于生物信息学工具研发的程序语言;

4.2 掌握生物信息学工具研发常用的数据结构和算法;

4.3 能够研发简单的软件或搭建数据库,并用于生物信息学领域的大数据分析。

5. 综合研究:有解决复杂问题的能力。能够综合运用生物信息学专业知识设计针对生物医学和大健康等领域数据分析问题的解决方案,并能够在方案设计环节中体现创新意识。

要求:能够按照“问题调研、方案设计、方案实施、总结归纳”的思路开展生物信息学问题的综合研究。

5.1 能够基于发现的生物信息学问题,通过文献调研或相关方法,充分了解问题的科学原理、科学价值;

5.2 能够根据生物信息学问题的特征属性,设计合理的生物信息学研究路线和方案;

5.3 能够综合应用大数据分析技能和方法实施研究方案,产生实验结果;

5.4 能够对实验结果进行分析、评判和解释,并通过信息综合得到合理有效的结论。

6. 沟通表达:具有较强的沟通表达能力。能够就生物信息学领域相关的数据分析问题和业界同行及社会大众进行有效沟通和交流,包括撰写报告、设计文稿、以及口头陈述与交流。

要求:能就生物信息学专业问题与同行和社会大众进行有效沟通和交流。

6.1 能就生物信息学领域相关的数据分析问题,以报告、文稿、口头陈述等方式,向业界同行准确表达自己的观点,回应质疑,且能理解同领域专家新看法和新观点;

6.2 能将生物信息学领域的专业知识以言简意赅、通俗易懂的方式向社会公众进行口头介绍或书面沟通。

7. 团队合作:具有良好的团队合作能力。能够与团队成员和谐相处,协作共事,并作为成员或领导者在团队活动中发挥积极作用。

要求:具有良好的团队协作能力,可以承担团队的不同角色。

7.1 能够认识到团队协作的重要性;

7.2 能够与团队成员有效沟通,协作开展工作;

7.3 能够组织、协调和指挥团队开展工作。

8. 全球理解力:具有国际视野和国际理解能力。及时了解生物医学大数据分析的最新理论、技术和国际动态,关注全球重大问题,理解和尊重世界不同文化的差异性和多样性,积极参与国际交流与合作。

要求:具备一定的国际学术视野和和跨文化交流的能力。

8.1 了解生物信息学专业领域的国际发展趋势、研究热点;

8.2 关注全球重大问题,理解和尊重世界不同文化,具备跨文化交流的语言和书面表达能力,能就生物信息学专业问题,在跨文化背景下进行基本沟通和交流。

9. 终身学习:具有终身学习意识和自我管理、自主学习能力,能够通过不断学习,适应社会和个人可持续发展。

要求:具备终身学习的思维和行动能力。

9.1 能在社会发展的大背景下,认识到自主和终身学习的必要性;

9.2 具有自主学习的能力。要不断跟踪生物信息学领域前沿,具备对该领域新理论、新技术的理解能力,归纳总结的能力和提出问题的能力等。

四、主干学科

生物学、数学、计算机科学与技术

五、主要课程及实践环节

主要理论课程:分子生物学、生物化学、程序设计基础、数据库原理、机器学习、生物统计学、生物信息学、组学理论及数据分析、大数据与精准医学。

实践环节:分子生物学实验、生物化学实验、高级程序语言实战、机器学习实战、生物信息学软件应用、组学数据分析实战、专业实习、毕业论文。

六、教育平台构成、学分安排、毕业学分及学位授予要求

课程类别

学分安排

毕业要求

占毕业要求总学分百分比

必修

通识类必修课程

46

最低取得143学分

81.71%

学科基础课程

44.5

专业必修课程

21.5

独立设置实践教学环节

31

选修

专业选修课程

33

最低取得22学分

18.29%

通识类选修课程

最低取得10学分

(其中美育类2学分;外语类2学分;创新创业教育类2学分;四史类1学分;人文社科经管类3学分)

毕业要求总合计

最低取得175学分

100%

学位授予要求:

1.修满培养方案要求的学分,经审核准予毕业。

2.不含毕业设计(论文)必修课平均学分绩≥70.0分。

3.在校期间无记过及以上处分。

七、教学安排

(一)教学计划

通识必修课程

课程编号

课程名称

考核方式

学分

学时/周数

开课学期

备注

讲授

实验

上机

实践

226000101

军事理论

考查

2

36

24

 

 

12

1

 

226000102

大学生心理健康教育

考查

2

32

16

 

 

16

1

 

227000101

大学生就业指导

考查

1

16

16

 

 

 

6

 

242000101

劳动教育(1

考查

1

16

16

 

 

 

1

 

243000103

程序设计基础(python语言)

考查

3.5

56

28

 

28

 

1

 

243000102

创业基础

考查

2

32

24

 

 

8

3

 

265139120

大学生职业生涯规划

考查

1.5

24

24

 

 

 

2

 

270000101

国家安全教育

考查

1

16

16

 

 

 

2

 

271000101

大学英语(1

考试

3

48

48

 

 

 

1

 

271000102

大学英语(2

考试

3

48

48

 

 

 

2

 

271000103

大学英语(3

考试

2

32

32

 

 

 

3

 

273000101

体育(1

考查

1

36

30

 

 

6

1

 

273000102

体育(2

考查

1

36

30

 

 

6

2

 

273000103

体育(3

考查

1

36

30

 

 

6

3

 

273000104

体育(4

考查

1

36

30

 

 

6

4

 

280000101

思想道德与法治

考试

3

48

40

 

 

8

2

 

280000103

马克思主义基本原理

考试

3

48

40

 

 

8

3

 

280000104

毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论

考试

5

80

72

 

 

8

6

 

280000105

中国近现代史纲要

考试

3

48

40

 

 

8

4

 

280000106

形势与政策(1

考查

0.25

8

8

 

 

 

1

 

280000107

形势与政策(2

考查

0.25

8

8

 

 

 

2

 

280000108

形势与政策(3

考查

0.25

8

8

 

 

 

3

 

280000109

形势与政策(4

考查

0.25

8

8

 

 

 

4

 

280000110

形势与政策(5

考查

0.25

8

8

 

 

 

5

 

280000111

形势与政策(6

考查

0.25

8

8

 

 

 

6

 

280000112

形势与政策(7

考查

0.25

8

8

 

 

 

7

 

280000113

形势与政策(8

考查

0.25

8

8

 

 

 

8

 

280000117

铸牢中华民族共同体意识

考试

2

32

24

 

 

8

2

 

280000118

习近平新时代中国特色社会主义思想概论

考试

2

32

16

 

 

16

6

 

学分/学时(周数)合计

46

852

708

 

28

116

 

 

学科基础课程

课程编号

课程名称

考核方式

学分

学时/周数

开课学期

备注

讲授

实验

上机

实践

243000101

程序设计基础(C语言)

考查

3.5

56

28

 

28

 

3

 

266000104

无机化学C

考试

4

64

48

16

 

 

1

 

266000108

有机化学C

考试

2.5

40

30

10

 

 

2

 

268000103

高等数学B(1)

考试

5.5

88

88

 

 

 

1

 

268000104

高等数学B(2)

考试

2.5

40

40

 

 

 

2

 

268000106

线性代数

考试

2.5

40

40

 

 

 

2

 

268000107

概率论与数理统计

考试

3

48

48

 

 

 

3

 

268000112

大学物理B

考试

4

64

64

 

 

 

2

 

282000101

生物化学A

考试

4.5

72

72

 

 

 

3

 

282000106

分子生物学B­­­­­­­

考试

3

48

48

 

 

 

4

 

282218101

生物信息学A

考试

2.5

40

40

 

 

 

4

 

282218103

生物统计学A

考试

4.5

72

56

 

16

 

4

 

282218105

生物数据的可视化(R语言)

考试

2.5

40

20

 

20

 

3

 

学分/学时(周数)合计

44.5

712

622

26

64

0

 

 

专业必修课程

课程编号

课程名称

考核方式

学分

学时/周数

开课学期

备注

讲授

实验

上机

实践

282000110

遗传学B

考试

3.5

56

46

10

 

 

5

 

282000113

细胞生物学B

考试

3

48

48

 

 

 

5

 

282218106

Linux系统及应用

考试

2.5

40

24

 

16

 

5

 

282218107

机器学习

考试

3.5

56

32

 

24

 

5

 

282218108

组学理论及数据分析

考试

3

48

24

 

24

 

6

 

282218109

数据库原理

考试

3

48

32

 

16

 

6

 

282218113

大数据与精准医学

考试

3

48

48

 

 

 

5

 

学分/学时(周数)合计

21.5

344

254

10

80

0

 

 

专业选修课程

课程编号

课程名称

考核方式

学分

学时/周数

开课学期

备注

讲授

实验

上机

实践

282000116

生命科学导论

考查

1

16

16

 

 

 

1

限选

282000115

普通生物学

考查

3

48

48

 

 

 

2

限选

282000119

实验室安全教育(1

考查

0.5

8

8

 

 

 

3

限选

282000120

实验室安全教育(2

考查

0.5

8

8

 

 

 

4

限选

282000104

微生物学B

考查

3

48

48

 

 

 

4

 

282218110

高级生物统计学

考试

2

32

24

 

8

 

5

限选

282149118

免疫学B

考查

2

32

32

 

 

 

5

 

265000103

企业管理与技术经济分析

考试

2

32

32

 

 

 

5

 

282218112

数字图像处理

考查

2.5

40

24

 

16 

 

6

 

282218114

数据结构与算法

考查

3

48

36

 

12 

 

6

限选

282218115

肿瘤信息学

考试

3.5

56

40

 

16

 

6

限选

282000122

表观遗传学

考查

2

32

32

 

 

 

7

限选

282218116

基因组学

考试

2

32

32

 

 

 

7

限选

282218117

结构生物学

考查

2

32

24

 

8 

 

7

限选

282149105

植物生理学

考查

2

32

32

 

 

 

7

 

282149120

环境生物学

考查

2

32

32

 

 

 

7

 

学分/学时(周数)合计

33

528

468

 

60

 

 

 

独立设置实践教学环节

课程编号

课程名称

考核方式

学分

学时/周数

开课学期

备注

讲授

实验

上机

实践

226000301

军训

考查

2

2

 

 

 

2

1

2~3

242000402

劳动教育(2

考查

1

32

 

 

 

32

7

 

268000203

物理实验B

考查

1

34

4

30

 

 

2

 

282000202

生物化学实验

考查

1

32

 

32

 

 

3

 

282000205

分子生物学实验

考查

1

32

 

32

 

 

4

 

282218201

高级程序语言实战

考查

1

32

4

 

28

 

3

 

282218202

生物信息学软件应用

考查

1

32

4

 

28

 

4

 

282218203

机器学习实战

考查

1

32

4

 

28

 

6

 

282218204

组学数据分析实战

考查

1

32

4

 

28

 

7

 

282218301

认识实习

考查

1

1

 

 

 

1

3

4

282218302

专业实习

考查

2

2

 

 

 

2

6

19~20

282218303

毕业设计(论文)

考查

18

18

 

 

 

18

8

1~18

学分/学时(周数)合计

31

258+

23

20

94

112

32+23

 

 

通识类选修课程

课程编号

课程名称

考核方式

学分

学时/周数

开课学期

备注

讲授

实验

上机

实践

282000401

创新创业实践

考查

2

32

 

 

 

32

7

限选

学分/学时(周数)合计

2

32

 

 

 

32

7

 

(二)教学进程

学期

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

24

25

26

R

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

=

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I

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Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

Φ

--

--

--

--

--

--

--

--





























 

说明:     理论教学            R    入学教育               军训                       考试
=      
假期                    ″     课程设计            Θ    金工实习            Ω    电子实习
I       
其它实习               实验、实训        S     社会实践            D    社会调查
L      
公益劳动            Φ    毕业设计(论文)

(三)教学数据统计

项目

学期

合计

理论教学周数

16

19

18

19

19

17

19

 

127

集中安排实践教学周数

2

 

1

 

 

2

 

18

23

安排总学分

25.25

27.25

25.25

19.75

21.75

26.25

14.25

18.25

178

必修理论教学环节

安排门数

9

11

9

6

6

6

1

1

49

安排学时

384

396

372

252

256

232

8

8

1908

安排学分

22.25

23.25

21.75

14.25

15.75

14.25

0.25

0.25

112

周学时

24.0

20.8

20.7

13.3

13.5

13.6

0.4

0.4

106.7

专业选修课

安排门数

1

1

1

2

3

3

5

0

16

安排学时

16

48

8

56

96

144

160

0

528

安排学分

1

3

0.5

3.5

6

9

10

0

33

实践环节

独立设置环节数

1

1

3

2

0

2

2

1

12

安排学分

2

1

3

2

0

3

2

18

31

八、辅修专业教学计划

课程编号

课程名称

考核方式

学分

学时/周数

备注

讲授

实验

上机

实践

243000103

程序设计基础(python语言)

考查

3.5

56

28

 

28

 

 

282000101

生物化学A

考试

4.5

72

72

 

 

 

 

282000106

分子生物学B

考试

3

48

48

 

 

 

 

282218003

生物统计学A

考试

4.5

72

56

 

16

 

 

282218101

生物信息学A

考试

2.5

40

40

 

 

 

 

282218105

生物数据的可视化(R语言)

考试

2.5

40

20

 

20

 

 

282218107

机器学习

考试

3.5

56

32

 

24

 

 

282218108

组学理论及数据分析

考试

3

48

24

 

24

 

 

282218201

高级程序语言实战

考查

1

32

4

 

28

 

 

282218202

生物信息学软件应用

考查

1

32

4

 

28

 

 

282218204

组学数据分析实战

考查

1

32

4

 

28

 

 

学分/学时(周数)合计

30

528

332

 

196

 

 

学生完成所有规定的教学环节学习,成绩合格,由学校颁发辅修专业结业证书。

九、专业培养目标与毕业要求相关矩阵

         培养目标

毕业要求

培养目标(一)

培养目标(二)

培养目标(三)

培养目标(四)

培养目标(五)

毕业要求1

 

 

 

 

毕业要求2

 

 

 

 

毕业要求3

 

 

 

毕业要求4

 

 

 

毕业要求5

 

 

 

毕业要求6

 

 

 

 

毕业要求7

 

 

 

 

毕业要求8

 

 

 

毕业要求9

 

 

 

十、课程能力矩阵

课程体系对毕业要求的支撑关系矩阵

课程名称

毕业要求

要求1

要求2

要求3

要求4

要求5

要求6

要求7

要求8

要求9

军事理论

 

 

 

 

 

 

 

 

大学生就业指导

 

 

 

 

 

 

 

 

程序设计基础(python语言)

 

 

 

 

 

 

 

大学生职业生涯规划

 

 

 

 

 

 

 

创业基础

 

 

 

 

 

 

 

大学英语(1-3

 

 

 

 

 

 

 

 

体育(1-4

 

 

 

 

 

 

 

 

思想道德与法治

 

 

 

 

 

 

 

 

马克思主义基本原理

 

 

 

 

 

 

 

 

毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论

 

 

 

 

 

 

 

 

习近平新时代中国特色社会主义思想概论

 

 

 

 

 

 

 

中国近现代史纲要

 

 

 

 

 

 

 

 

形势与政策(1-8

 

 

 

 

 

 

 

大学生心理健康教育

 

 

 

 

 

 

 

 

铸牢中华民族共同体意识

 

 

 

 

 

 

 

 

劳动教育(1-2

 

 

 

 

 

 

 

国家安全教育

 

 

 

 

 

 

 

 

无机化学C

 

 

 

 

 

 

 

有机化学C

 

 

 

 

 

 

 

高等数学B

 

 

 

 

 

 

 

线性代数

 

 

 

 

 

 

 

概率论与数理统计

 

 

 

 

 

 

 

大学物理B

 

 

 

 

 

 

 

 

生物化学A

 

 

 

 

 

 

 

分子生物学B

 

 

 

 

 

 

生物信息学A

 

 

 

 

 

机器学习

 

 

 

 

 

 

生物统计学A

 

 

 

 

 

 

程序设计基础(C语言)

 

 

 

 

 

 

 

生物数据的可视化(R语言)

 

 

 

 

 

 

Linux系统及应用

 

 

 

 

 

 

数据库原理

 

 

 

 

 

 

 

组学理论及数据分析

 

 

 

 

 

 

大数据与精准医学

 

 

 

 

 

 

遗传学B

 

 

 

 

 

 

 

细胞生物学B

 

 

 

 

 

 

 

普通生物学

 

 

 

 

 

 

 

 

微生物学B

 

 

 

 

 

 

 

 

免疫学

 

 

 

 

 

 

 

植物生理学

 

 

 

 

 

 

 

 

环境生物学

 

 

 

 

 

 

 

 

肿瘤信息学

 

 

 

 

 

 

表观遗传学

 

 

 

 

 

 

 

基因组学

 

 

 

 

 

 

高级生物统计学

 

 

 

 

 

 

 

结构生物学

 

 

 

 

 

 

数字图像处理

 

 

 

 

 

 

 

企业管理与技术经济分析

 

 

 

 

 

 

 

 

实验室安全教育

 

 

 

 

 

 

 

 

生命科学导论

 

 

 

 

 

 

数据结构与算法

 

 

 

 

 

 

 

军训

 

 

 

 

 

 

 

 

物理实验B

 

 

 

 

 

 

 

 

生物化学实验

 

 

 

 

 

 

 

分子生物学实验

 

 

 

 

 

 

 

认识实习

 

 

 

 

 

 

专业实习

 

 

 

 

 

 

毕业论文

 

 

 

 

 

生物信息学软件应用

 

 

 

 

 

 

 

机器学习实战

 

 

 

 

 

 

 

高级程序语言实战

 

 

 

 

 

 

组学数据分析实战

 

 

 

 

 

 

 

创新创业实践

 

 

 

 

 

 

 

十一、方案制定人员

人:邢永强

    笔:邢永强、孟虎

    员:蔡禄、刘国庆、崔向军、刘国君

同行专家及企业专家:陈铭教授(浙江大学)、张勇教授(同济大学)

方案审核:王国泽、赵宏宇

 

 

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