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邢永强

发布日期:2023-09-01   阅读:[]

邢永强2寸照红底

男,1984.02,内蒙古四子王旗人,中共党员,博士,教授,硕士研究生导师,内蒙古科技大学生物信息学系主任,主要从事生物信息学方面的教学和科研工作。

E-mailxingyongqiang1984@163.com

教育经历

2017.08-2018.08  美国德克萨斯大学达拉斯分校,系统生物学中心,访问学者

2016.09-2016.12  北京语言大学,出国留学外语培训

2010.09-2014.06  内蒙古大学物理科学与技术学院生物物理学,博士

2006.09-2009.06  内蒙古大学物理科学与技术学院生物物理学,硕士

2002.09-2006.06  内蒙古师范大学物理与电子信息学院物理学,学士

工作经历

2021.01-至今    内蒙古科技大学生命科学与技术学院,教授,硕士生导师

2016.03-2020.12  内蒙古科技大学生命科学与技术学院,副教授,硕士生导师

2016.01-2016.02  内蒙古科技大学数理与生物工程学院,副教授,硕士生导师

2012.01-2015.12  内蒙古科技大学数理与生物工程学院,讲师

2009.07-2011.12  内蒙古科技大学数理与生物工程学院,助教

教学概况

主讲了《组学理论及数据分析》、《生物数据的可视化》、《高级程序语言实战》、《生物信息学软件应用》、《生物统计学》、《生物信息学》、《生物信息学导论》等本科生课程,《基因组学》、《遗传学前沿进展》、《生物信息学》、《表观遗传学》等研究生课程;发表教学相关学术论文4篇;主持校级和省部级教学改革项目各2项;参编《生物信息学》教材1部;参与了《生物信息学》自治区一流课程的建设。

科研概况

近年来,主要围绕胚胎发育、疾病发生等过程中的RNA可变剪接和表观遗传调控等领域开展学术研究工作。已主持4项国家自然科学基金(其中1项为面上项目)和2项内蒙古自治区自然科学基金;获内蒙古科技大学优秀青年科学基金资助累计在专业领域期刊发表高水平论文40余篇;参编专著1部;入选内蒙古自治区草原英才工程青年创新人才和内蒙古自治区高等院青年科技英才。现任内蒙古生物物理与生物信息学会常务理事兼副秘书长、内蒙古健康数字学会理事,中国生物信息学学会()多表观遗传学学专业委会委员、中国生物信息学学会()多组学与整合生物学专委会委员、中国医药教育协会数字医疗专业委员会委员等。作为骨干成员,协助团队带头人申请获批并建设了内蒙古自治区表观遗传学与生物信息学创新团队内蒙古自治区功能基因组生物信息学重点实验室

代表性论著

[1]     Lei Zheng, Pengfei Liang, Chunshen Long, Hanshuang Li, Haicheng Li, Yuchao Liang, Xiang He, Qilemuge Xi, Yongqiang Xing*, Yongchun Zuo*. EmAtlas: a comprehensive atlas for exploring spatiotemporal activation in mammalian embryogenesis. Nucleic Acids Research, 2023, 51(D1):D924-D932.

[2]     Jinzhao Li, Xiang He, Shuang Gao, Yuchao Liang, Zhi Qi, Qilemuge Xi, Yongchun Zuo*, Yongqiang Xing*. The Metal-binding Protein Atlas (MbPA): an integrated database for curating metalloproteins in all aspects. Journal of Molecular Biology, 2023, 435(14):168117.

[3]     Hao Wang, Zhaoyue Zhang, Haicheng Li, JinZhao Li, HanShuang Li, MingZhu Liu, Pengfei Liang, Qilemuge Xi, Yongqiang Xing*, Lei Yang*, Yongchun Zuo*.A cost-effective machine learning-based method for preeclampsia risk assessment and driver genes discovery. Cell & Bioscience, 2023, 13:41.

[4]     Lei Zheng, Dongyang Liu, Yuan Alex Li, Siqi Yang, Yuchao Liang, Yongqiang Xing *, Zuo Yongchun*. RaacFold: a webserver for 3D visualization and analysis of protein structure by using reduced amino acid alphabets. Nucleic Acids Research, 2022, 50(W1): W633-W638.

[5]     Zhe Liu, Wei Wang, Xinru Li, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao, Wuritu Yang, Yongchun Zuo, Lu  Cai, Yongqiang Xing*. Temporal dynamic analysis of alternative splicing during embryonic development in Zebrafish. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2022, 10:879795.

[6]     Hongyu Zhao, Mingxin Guo, Fenghui Zhang, Xueqin Shao, Guoqing Liu, Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Liaofu Luo, Lu Cai. Nucleosome assembly and disassembly in vitro are governed by chemical kinetic principles. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9:762571.

[7]     Guoqing Liu*, Hongyu ZhaoHu MengYongqiang XingLu Cai. A deformation energy model reveals sequence-dependent property of nucleosome positioning. Chromosoma, 2021, 130(1):27-40.

[8]     Jun Li, Hongyu Zhao,Yongqiang Xing,Tongling Zhao, Lu Cai*, Zuwei Yan*. A genome-wide analysis of the gene expression and alternative splicing events in a whole-body hypoxic preconditioning mouse model. Neurochemical Research, 2021, 46(5):1101-1111.

[9]     Hongyu Zhao, Zhiyan Jiang, Runchao Lv, Xue Li, Yongqiang Xing, Yanrong Gao, Da Lv, Yangming Si, Jingyan Wang, Jun Li, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. Tranncriptome profile analysis reveals a slica-induced immune response and fibrosis in a silicosisrat model. Toxicology Letters, 2020, 333:42-48.

[10]  Yongqiang Xing, Wuritu Yang, Guoqing Liu, Xiangjun Cui, Hu Meng, Hongyu Zhao, Xiujuan Zhao, Jun Li, Zhe Liu, Michael Q. Zhang*, Cai L*. Dynamic alternative splicing during mouse preimplantation embryo development. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2020, 8:35.

[11]  Hongyu Zhao, Fenghui Zhang, Mingxin Guo, Yongqiang Xing, GuoQing Liu, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. The affinity of DNA sequences containing R5Y5 motif and TA repeatswith 10.5-bp periodicity to histone octamer in vitro. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 2019, 37(8):1935-1943.

[12]  Guoqing Liu*, Yongqiang Xing, Hongyu Zhao, Lu Cai, Jianying Wang. The implication of DNA bending energy for nucleosome positioning and sliding. Scientific Reports, 2018, 8:8853:1-12.

[13]  Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Tao Yu, Dong liang, Jun Li, Guanyun Wei, Guoqing Liu, Xiangjun Cui, Hongyu Zhao and Lu Cai*. MiasDB: A database of molecular interactions associated with alternative splicing in human pre-mRNAs. PloS ONE, 2016, 11(5): e0155443.

[14]  Guoqing Liu*, Yongqiang Xing, Hongyu Zhao, Jianying Wang, Yu Shang, Lu Cai*. A deformation energy-based model for predicting nucleosome dyads and occupancy. Scientific Reports, 2016, 6:24133:1-14.

[15]  Xiangjun Cui, Lu Cai, Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Chenxia Shi. Influence factors on the correlations between expression levels of neighboring pattern genes. Biosystems, 2016, 139: 23-28.

[16]  Guoqing Liu*, YongqiangXing, Lu Cai*. Using weighted features to predict recombination hotspots in Saccharomy cescerevisiae. Journal of Theoretical Biology, 2015, 382:15-22.

[17]  Hongyu Zhao, Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Ping Chen, Xiujuan Zhao, Guohong Li*, Lu Cai*. GAA triplet-repeats cause nucleosome depletion in the human genome. Genomics, 2015, 106(2): 88-95.

[18]  Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao, Lu Cai*. Genome-wide characterization and prediction of Arabidopsis thaliana replication origins. Biosystems, 2014, 124:1-6.

[19]  Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. An analysis and prediction of nucleosome positioning based on information content. Chromosome Research, 2013, 21(1):63-74.

[20]  Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Lu Cai*. Prediction of Nucleosome Occupancy in Saccharomyces cerevisiae Using Position-Correlation Scoring Function. Genomics, 2011, 98(5): 359-366.

[21]  王伟, 刘喆, 邢永强*. 秀丽隐杆线虫肠发育过程中的基因表达和可变剪接动态时序分析. 基因组学与应用生物学, 2022,41(06):1215-1226.

[22]  邢永强*, 王延新, 何泽学, 崔向军, 刘国庆, 孟虎, 赵宏宇, 赵秀娟, 蔡禄*. 拟南芥种子萌发过程中差异表达基因的识别和pre-mRNA可变剪接图谱的构建. 科学通报, 2019, 64(36):3844-3855.

[23]  邢永强* , 何泽学, 刘国庆, 蔡禄*. 拟南芥不同组织基因表达及可变剪接差异分析. 生物化学与生物物理进展, 2019, 46(11): 1118-1129.

[24]  邢永强, 刘国庆, 蔡禄*. 生物信息学的本科专业建设现状. 生物信息学, 2020, 18(3):195-200.

[25]  斯阳明, 邢永强, 蔡禄*. 肝癌血小板RNA-seq数据的可变剪接分析. 内蒙古科技大学学报, 2016, 35(3):274-279.

[26]  李珺, 邢永强, 蔡禄*. RNA结合蛋白Sam68 及其功能,中国生物化学与分子生物学报,2017, 33(6): 555-563.

[27]   梁栋, 邢永强, 蔡禄*. 肾肿瘤相关基因的共表达网络构建与分析. 中国生物工程杂志, 2016, 36(2):30-37.

[28]  邢永强, 刘国庆, 蔡禄*. Pre-mRNA选择性剪接的调控及选择性剪接数据库. 中国生物化学与分子生物学报, 2016, 32(1):17-28.

[29]   赵宏宇, 刘媛, 张凤慧, 邢永强, 蔡禄*. 体外组装含有组蛋白变体H2A.ZH3.3的核小体. 中国生物工程杂志, 2016, 36(3):53-60.

[30]  魏官云, 邢永强, 蔡禄*. 人类转录因子与剪接因子互作网络的构建与分析. 生物物理学报, 2014, 30(3):238-246

[31]  邢永强, 赵宏宇, 刘国庆, 赵秀娟, 蔡禄*. 裂殖酵母复制起始位点的序列特征分析和预测. 生物物理学报, 2014, 30(6):1-12

[32]  王成爱, 赵宏宇, 邢永强, 邵灵俐, 蔡禄*. 酿酒酵母核小体定位理论模型的体外实验验证.生命科学研究, 2014, 18(1): 21-27.

[33]  刘国庆*, 包通拉嘎, 邢永强, 李宏, 蔡禄. 果蝇基因组回文序列的分布.生物物理学报, 2011, 27(7):643-652.

[34]  刘国庆*, 白音宝力高, 邢永强. 假基因研究进展. 生物化学与生物物理进展, 2010, 37(11): 1165-1174.

[35]  刘佳, 蔡禄*, 邢永强. IDQD算法预测人类蛋白质相互作用. 生物信息学, 2010, 8(4):341-346.

[36]  刘佳, 蔡禄*, 裴智勇, 邢永强. 基于蛋白序列的IDQD算法预测蛋白质相互作用. 生物数学学报, 2010, 25(3):501-507.

[37]  邢永强, 张利绒*, 罗辽复. 老鼠基因组盒式外显子和内含子保留型可变剪接位点预测.内蒙古大学学报, 2009, 40(5):576-582.

[38]  陈伟, 罗辽复*, 张利绒, 邢永强. 核小体定位与RNA剪接. 生物化学与生物物理进展, 2009, 36(8):1035-1040.

[39]  邢永强, 张利绒*, 罗辽复. 人类基因组盒式外显子和内含子保留的可变剪接位点预测.生物物理学报, 2008, 24(5): 393-401.

[40]  张利绒*, 罗辽复, 邢永强, 晋宏营. 人类基因组中可变和组成性剪接位点的预测. 生物化学与生物物理进展, 2008, 35(10):1188-1194.

[41]  教材: 蔡禄, 邢永强, 崔向军, 刘国庆, 崔大超. 《生物信息学》, 标准书号: 978-7-030-55335-5, 科学出版社, 62.9万字, 2017.

[42]  专著: 蔡禄, 赵秀娟, 刘国庆, 崔向军, 马利兵, 赵宏宇, 邢永强. 表观遗传学前沿》, 标准书号: 978-7-302-30817-1, 清华大学出版社, 49.3万字, 2012.

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