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赵宏宇

发布日期:2023-04-17   阅读:[]

赵宏宇

男,1979.12,内蒙古乌兰察布市人

博士,三级教授,硕士生导师,九三学社社员

内蒙古科技大学生命科学与技术学院,副院长

包头市第十四届政协委员

内蒙古生物工程学会,常务理事、副秘书长

内蒙古生物物理与生物信息学学会,理事

中国生物信息学学会表观遗传信息学专业委员会委员

内蒙古科技大学党外知识分子联谊会,常务理事

包头市昆都仑区党外知识分子联谊会,副会长

九三学社包头市委委员

九三学社包头市高新支社,副主任委员

E-mailzhaohongyu2000@163.com

 

教育与学习经历:

1998.09-2002.07 包头钢铁学院/天津大学生物化工系学习, 工学学士

2006.09-2009.07 内蒙古科技大学包头医学院基础医学院学习, 生物化学与分子生物学,硕士

2012.09-2016.06内蒙古大学物理学院学习, 生物信息学,博士

2011.03-2011.092014.10-2014.112018.7-2018.8 中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室, 高级访问学者

 

工作经历:

2002.07-2008.05内蒙古科技大学生化学院,助教

2008.05-2008.12内蒙古科技大学生化学院,讲师

2009.01-2012.12内蒙古科技大学数理生学院,讲师

2013.01-2016.03内蒙古科技大学数理生学院,副教授,系主任

2016.03-2018.11内蒙古科技大学生命科学与技术学院,副教授,系主任

2018.12-2021.08 内蒙古科技大学生命科学与技术学院,教授,系主任

2021.08- 内蒙古科技大学生命科学与技术学院,教授,副院长

 

研究方向:

1)肺纤维化的分子机制。矿山开采、粉碎分选等过程中产生的高浓度二氧化硅、金属化合物及煤炭等粉尘在人体肺部潴留是引起尘肺病等职业病的重要原因。尘肺病的病理特征主要是肺部慢性炎症和肺组织进行性纤维化。我们构建了多个尘肺病的动物模型和细胞模型,从理论和实验两个角度,结合多组学测序、生物信息学、细胞生物学、分子生物学、生物化学等方法与技术,针对肺纤维化发生发展的不同阶段从细胞间通讯与互作等角度尝试解析肺纤维化发生发展过程中的分子机制,期望促进对肺纤维化致病机理的理解,最终目标是寻找到肺纤维化早期的生物标记物,为尘肺病的预防和早期治疗提供一种可行的方案或参考依据。

2)表观遗传学。主要关注基因表达调控在表观遗传学层面的调控机制,结合生物信息学、分子生物学、生物物理学、生物化学、细胞生物学等相关理论方法与实验技术,尝试深入理解包括核小体定位、染色质结构与功能、pre-mRNA可变剪接等相关问题的分子机制及它们对疾病发生发展过程的调控机理。

3发酵工艺调控与天然产物分离。与自治区多家发酵企业合作,开发新产品生产工艺、优化发酵工艺、选育高产菌株,参与的多项企业生产技改成果已应用到生产中。采用多种工艺提取了艾草、黄芪等中药材的主要活性成分,开发了一系列洗化、护理、医药保健等高端产品,部分产品已进入生产商业化阶段。

 

教学情况:

为本科生讲授过《生物工程导论》《生命科学导论》《发酵工程》《生物反应工程》《生物工艺学》《生物反应器》《生物过程检测与控制》《代谢控制与发酵》《生命科学与健康》等课程;讲授及指导过《生物化学实验》《分子生物学实验》《生物工程专业实验》《发酵工艺实验》等实验课程;累计指导本科生毕业设计及毕业论文260余人。为研究生讲授《遗传学进展》《表观遗传学》等课程。

 

科研项目:

1.       基于单细胞RNA测序解析肺纤维化病理进程中的细胞间通讯,国家自然科学基金,主持,2023.1-2026.12

2.       组蛋白及其变体H2A.ZH3.3体外装配核小体的动力学特征研究,国家自然科学基金,主持,2018.1-2021.12

3.       TGF-β/Smad信号通路调控尘肺病相关靶基因的筛选及其分子机制的研究,内蒙古自然科学基金,主持,2021.1-2023.12

4.       尘肺病病理进程中的细胞间通讯关系,内蒙古自治区直属高校基本科研业务费,优秀青年基金,主持,2022.9-2024.8

5.       R5Y5序列模体对核小体定位调控的体外实验研究,内蒙古自然科学基金,主持,2017.1-2019.12

6.       与人类遗传病相关的DNA重复序列对核小体定位调控的体外实验研究,内蒙古自然科学基金项目,主持,2013.011--2015.12

7.       动植物基因组可变剪接调控机制差异的多维度剖析,国家自然科学基金项目,主要参加人,2017.1-2020.12

8.       RNA序列物理特性和表观遗传信息对pre-mRNA选择性剪接位点识别的调控,国家自然科学基金项目,主要参加人,2016.1-2016.12

9.       基于DNA序列、结构及表观遗传信息的酵母复制起始位点的预测与实验研究,国家自然科学基金项目,主要参加人,2014.1-2017.12

10.    酿酒酵母组蛋白修饰的因果组合关系分析,国家自然科学基金项目,主要参加人,2013.1-01--2016.12

11.    可变剪接相关生物大分子相互作用网络的构建与分析,国家自然科学基金项目,主要参加人,2013.1-2016.12

12.    基于基因组序列和结构特征的核小体定位的理论和实验研究,国家自然科学基金项目,主要参加人,2011.1-2013.12

13.     内蒙古自治区表观遗传学与生物信息学科技创新团队,内蒙古自治区应用技术研究与开发资金项目,主要成员,2014.1-2016.12

 

教学项目:

1.       本科教育提质创新-工程教育认证-生物工程,中央支持地方高校改革发展项目第二批专项,负责人,2022.7-2024.7

2.       生物工程专业发酵课程群建设与研究,内蒙古教育厅教学项目,主持,2016.5-2018.12

3.       以发酵课程群及教学团队建设促进生物工程专业学生实践能力的培养,内蒙古科技大学教改项目,主持,2016.12-2018.12

4.       新培养方案下生物工程专业课程体系和教学内容改革的研究与实践,内蒙古科技大学教改项目,主持,2013.10-2014.10

5.       《生化反应工程》重点建设课,内蒙古科技大学课程建设项目,主持,2014.6-2015.12

6.       生物工程专业毕业设计(论文)管理模式改革,内蒙古科技大学教改重点项目,主持,2010.10-2012.10

7.       生物工程专业综合性大实验体系的构建,内蒙古科技大学教改项目,主持,2009.10-2010.10

8.       生物工程专业综合改革试点,内蒙古科技大学专业改革专项,负责人,2014.1-2018.12

9.       工程教育专业认证培育(生物工程) ,内蒙古科技大学专业认证专项 ,负责人,2017.10-2019.10

 

科研文章:

1.       杨慧楠,吕达,王乐,刘春城,姜志艳,赵宏宇*,蔡禄*.TGF-β/Smad信号通路中关键基因在肺纤维化进程中的功能.环境与职业医学, 2022, 39(07): 745-751.

2.       Zhe Liu, Wei Wang, Xinru Li, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao, Wuritu Yang, Yongchun Zuo, Lu Cai, Yongqiang Xing, Temporal Dynamic Analysis of Alternative Splicing During Embryonic Development in Zebrafish, Front Cell Dev Biol. 2022, 10:879795.

3.       邵学勤,郭明欣,蔡禄,赵宏宇*,盐离子作用下组蛋白变体H2A.Z增强核小体结构的稳定性,中国生物化学与分子生物学报,20223803):372-380.

4.       Hongyu Zhao, Mingxin Guo, Fenghui Zhang, Xueqin Shao, Guoqing Liu, Yongqiang Xing, Xiujuan Zhao, Liaofu Luo, Lu Cai. Nucleosome Assembly and Disassembly in vitro Are Governed by Chemical Kinetic Principles. Front. Cell Dev. Biol., 2021, 9:762571.

5.       Li J, Zhao H, Xing Y, Zhao T, Cai L, Yan Z. A Genome-Wide Analysis of the Gene Expression and Alternative Splicing Events in a Whole-Body Hypoxic Preconditioning Mouse Model. Neurochem Res. 2021, 46(5):1101-1111.

6.       吕达,杨慧楠,刘春城,王乐,赵宏宇*,蔡禄*.二氧化碳染尘小鼠肺纤维化相关炎症和氧化应激因子的响应及关键基因表达,环境与职业医学,2021,3810):1150-1155.

7.       李雪,吕达,杨慧楠,王晶妍,高艳荣,邢永强,赵宏宇*,蔡禄*.大鼠Mocs2基因跳跃型外显子可变剪接保留率的检测,基因组学与应用生物学,2021403):1015-1021

8.       Guoqing Liu, Hongyu Zhao, Hu Meng, Yongqiang Xing, Hui Yang, Hao Lin, Deform-nu: a DNA deformation energy-based predictor for nucleosome positioning, Frontiers Cell and Developmental Biology, 2020, 8:596341.

9.       Zhao H, Jiang Z, Lv R, Li X, Xing Y, Gao Y, Lv D, Si Y, Wang J, Li J, Zhao X, Cai L. Transcriptome profile analysis reveals a silica-induced immune response and fibrosis in a silicosis rat model. Toxicol Lett., 2020, 333:42-48. 

10.    Xing Y, Yang W, Liu G, Cui X, Meng H, Zhao H, Zhao X, Li J, Liu Z, Zhang MQ, Cai L. Dynamic Alternative Splicing During Mouse Preimplantation Embryo Development. Front Bioeng Biotechnol. 2020, 8:35.

11.    史晨霞,赵秀娟,赵宏宇,崔向军,酿酒酵母几个组蛋白修饰间的因果组合关系分析,内蒙古大学学报(自然科学版)202004411-417.

12.    邢永强,王延新,何泽学,崔向军,刘国庆,赵宏宇,赵秀娟,蔡禄,拟南芥种子萌发过程中差异表达基因的识别和pre-mRNA可变剪接图谱的构建,科学通报,2019641-13.

13.    郭明欣,张凤慧,邵学勤,赵秀娟,蔡禄*赵宏宇*,荧光热漂移实验体外检测核小体的解聚,中国生物化学与分子生物学报,2019359):1021-1028.

14.    张凤慧,郭明欣,赵宏宇*,蔡禄*,体外装配核小体过程组蛋白浓度依赖的动力学模型,基因组学与应用生物学,2019387):1-6.

15.    Zhao H, Zhang F, Guo M, Xing Y, Liu G, Zhao X, Cai L. The affinity of DNA sequences containing R5Y5 motif and TA repeats with 10.5-bp periodicity to histone octamer in vitroJ Biomol Struct Dyn. 2019, 37(8): 1935-1943.

16.    Liu G, Xing Y, Zhao H, Cai L, Wang J. The implication of DNA bending energy for nucleosome positioning and sliding. Sci Rep. 2018, 8(1):8853. 

17.    赵宏宇,吕润超,姚林林,张凤慧,姜志艳,蔡禄,半定量RT-PCR检测跳跃型可变剪接外显子保留率的方法,基因组学与应用生物学,2018,3711):4763-4768.

18.    姚林林,李珺,赵宏宇,蔡禄,NF1微基因及突变体微基因的克隆与鉴定.基因组学与应用生物学,2018,374):1832-1837.

19.    刘媛,张凤慧,赵宏宇,蔡禄,组蛋白八聚体的装配及荧光标记检测体外组装核小体的效率.江苏农业科学,2017,4514):12-16.

20.    Xing Y, Zhao X, Yu T, Liang D, Li J, Wei G, Liu G, Cui X, Zhao H, Cai L. MiasDB: a database of molecular interactions associated with alternative splicing of human pre-mRNAs. PLoS One, 2016, 11(5): e0155443.

21.    Guoqing Liu, Yongqiang Xing, Hongyu Zhao, Jianying Wang, Yu Shang, Lu Cai. A deformation energy-based model for predicting nucleosome dyads and occupancy. Scientific Reports, 2016, 6:24133.

22.    赵宏宇,刘媛,张凤慧,邢永强,蔡禄*.体外组装含有组蛋白变体H2A.ZH3.3的核小体. 中国生物工程杂志,2016, 36(3): 53-60.

23.    Hongyu Zhao, Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Ping Chen, Xiujuan Zhao, Guohong Li, Lu Cai, GAA triplet-repeats cause nucleosome depletion in the human genome, Genomics, 2015, 106(2): 88-95.

24.    赵宏宇,柴荣,王成爱,蔡禄,盐透析体外组装核小体及检测方法,河南师范大学学报(自然科学版),2014,42(1):133-136.

25.    王成爱,赵宏宇,邢永强,邵灵俐,蔡禄,酿酒酵母核小体定位理论模型的体外实验验证,生命科学研究,201418(1):21-27.

26.    Yongqiang Xing, Guoqing Liu, Xiujuan Zhao, Hongyu Zhao, Lu Cai, Genome-wide characterization and prediction of Arabidopsis thaliana replication origins, BioSystems, 2014, 124:1-6.

27.    邢永强,赵宏宇,刘国庆,赵秀娟,蔡禄,裂殖酵母复制起始位点的序列特征分析和预测,生物物理学报,2014, 30(6): 463-472.

28.    柴荣,赵宏宇,蔡禄,与人遗传病相关的DNA重复序列的体外核小体定位特性,基础医学与临床,2013333):314-319.

29.    王晶妍,王建英,玉花,赵宏宇,赵亮,辛翠花,王彬,布鲁氏菌外膜蛋白OMP31基因克隆及番茄转化,生物技术通报,2013, 9:119-123.

30.    王成爱,赵宏宇,邢永强,蔡禄,基于位置权重矩阵计算酵母核小体定位的体外实验研究,生物物理学报,2013,29.

31.    赵宏宇,赵玥,王建英,李珺,蔡禄,5-溴脱氧尿嘧啶核苷标记酿酒酵母基因组DNA的方法,中国生物工程杂志,2012,321):81-86.

32.    赵宏宇,蔡禄,赵秀娟,王晶妍,丝裂霉素C 对含重复序列质粒的大肠杆菌致死率的模型化,华西药学杂志,2011,261):9-10.

33.    赵宏宇,李珺,赵玥,王馨,蔡禄,4 种酵母基因组提取方法的比较,食品科学,2011,329):170-173.

34.    赵玥,赵宏宇,蔡禄,一种从酵母细胞中提取组蛋白的方法,生物技术通报,2011,11,225-228.

35.    赵宏宇,蔡禄,赵秀娟,王晶妍,陈元秀,刘水峰,化学药物导致的与Friedreich共济失调相关的GAA重复序列不稳定性的研究,生物技术通报,20101 147-153.

36.    赵宏宇,蔡禄,赵秀娟,王晶妍,李晶,三种快速制备含重复序列PCR模板的方法,生物技术通报,20102119-122.

37.    赵宏宇,蔡禄,赵秀娟,王晶妍,陈元秀,刘水峰,化学药物对与人遗传病相关的DNA重复序列不稳定性的影响,生物技术通报,2010, 11:153-161.

38.    Hongyu ZhaoYue ZhaoRong ChaiLu CaiInstability of the DNA repeats mutation in humans hereditary disorders2011 International Conference on Remote Sensing, Environment and Transportation Engineering20116899-6902.

 

教学文章:

1.       张小利,秦哲,李雅丽,卢庆华,赵宏宇,地方院校实验室辅助创新创业学分认定路径探析与保障体系构建——以生物学科类实验室为例,科技视界,2020, 25:1-5.

2.       陈敏洁,巩东辉,赵宏宇,基于雨课堂的《酶工程》课程线上线下混合教学设计,科技视界,202010107-109.

3.       卢庆华,李雅丽,王蕾,赵宏宇,生物工程啤酒发酵创新平台的构建和作用,西部素质教育, 202002182-183.

4.       卢庆华,李雅丽,王蕾,赵宏宇,以科技创新为导向的生物工程发酵实验课程设计,广州化工,4720):199-190.

5.       李雅丽,赵宏宇,王国泽,季祥,卢庆华,地方工科院校大学生创新创业学分体系的实施以内蒙古科技大学生物工程专业为例,西部素质教育,2019,616-18.

6.       赵宏宇,李雅丽,蔡禄,以服务地区经济为导向的生物工程专业改革的探索,广东化工,2018,4515):226,208.

7.       蒋海明,李侠,刘振旺,张鹏,李玲,赵宏宇,厌氧微生物培养实验教学改革与实践,实验室研究与探索(核心期刊),2018,372):165-169.

8.       李雅丽,赵秀娟,巩东辉,赵宏宇,王晶妍,研究生分子生物学实验教学改革与实践,实验技术与管理(核心期刊),2016336:4-6.

9.       赵宏宇,季祥,蔡禄,生物工程专业发酵课程群建设探索,微生物学通报(核心期刊),2016, 43(4).

10.    王蕾,赵宏宇,季祥,生物工程本科专业实验教学改革的探索,实验科学与技术,2015, 13(1): 77-79.

11.    赵宏宇,季祥,郑春丽,王蕾,卢庆华,李雅丽,蔡禄,地方院校生物工艺学课程教学方法的探索,实验技术与管理(核心期刊),2014, 31(12):185-187.

12.    蒋海明,赵宏宇,大学生参与科研与科技创新活动的必要性及作用探讨,广州化工,2014, 42(21):201-203.

13.    王蕾,赵宏宇,季祥,生物工程设备教学改革的探索和实践,科技视界,2014, 10: 58.

14.    赵宏宇,徐永斌,季祥,赵秀娟,蔡禄,生物工程专业实践教学环节改革探索,2011 Teaching Seminars on Higher Education Science and Engineering Courses1350-1353.

15.    季祥,赵秀娟,赵宏宇,蔡禄,加强毕业论文工作的建议,2011 Teaching Seminars on Higher Education Science and Engineering Courses1448-1450.

16.    徐永斌,赵宏宇,季祥,蔡禄,浅谈本科毕业论文的指导,2011 Teaching Seminars on Higher Education Science and Engineering Courses1603-1605

17.    徐永斌,赵宏宇,生物工程专业毕业实习新模式的探索,中国轻工教育,2011, 4:67-69..

18.    赵宏宇,季祥,张小利,王蕾,蔡禄,生物工程专业综合性大实验体系的探索,实验科学与技术,2009Vol.7No.5105-107.

 

专著:

1.       赵宏宇,赵秀娟 著,《染色质结构与功能》,哈尔滨工业大学出版社,2018年,共计28.4万字,本人撰写21.2万字

2.       蔡禄主编,赵宏宇参编,《表观遗传学前沿》,清华大学出版社,2012年,撰写《表观遗传学实验技术简介》一章中5-7节及《非编码RNA数据库》一节,共计5.3万字。

教材:

1.       马利兵主编,赵宏宇参编,《动物细胞工程》,吉林大学出版社,2010年,撰写《体外大规模培养动物细胞》一章,共计4.5万字。

 

专利:

1.       赵宏宇,蔡禄,张凤慧,赵秀娟,刘国庆,一种DNA序列特定位点装配染色质结构能力的检测方法,ZL201710903858.2

2.       赵秀娟,蔡禄,郑春丽,赵宏宇,一株具有镍耐受性的酿酒酵母组蛋白定点突变菌株及其应用,ZL201710366706.3

3.       王蕾,卢庆华,蔡禄,李雅丽,赵宏宇,一种新型荞麦保健啤酒及其制备方法, CN201810716168.0

 

 

教学获奖:

1.       2020年内蒙古科技大学优秀实习指导教师

2.       2019年内蒙古科技大学本科毕业设计(论文)优秀指导教师

3.       第二届全国大学生生命科学竞赛二等奖,项目名称:地塞米松和螺旋藻对矽肺病大鼠肺部纤维化的影响,指导老师:赵宏宇,姜志艳,团队学生:赵英伟、李怡皖、张印丹、刘亚丽、石伟,20181125

4.       2017年内蒙古科技大学师德师风先进个人

5.       2016年内蒙古科技大学本科毕业设计(论文)优秀指导教师

6.       2015年内蒙古科技大学教学优秀奖

7.       生物学科本科毕业设计(论文)管理模式改革,2013年校级教学成果二等奖,排名第一

8.       科研成果转化为本科教学内容的探索与实践2013年校级教学成果二等奖,排名第二

9.       2009年内蒙古科技大学师德先进个人

 

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